Организация на УСН в 2024 году превысила 60 млн., но в 1 кв. 2025 не начисляли НДС, вопрос: какие будут штрафы и пени? Переделывать все реализации и указывать в них НДС?

Правительство поддержало организации на УСН, которые впервые стали плательщиками НДС. Их не будут штрафовать по п. 1 ст. 119 НК РФ за неподачу в срок первой декларации по НДС за любой из кварталов 2025 года (Постановление Правительства РФ от 23.04.2025 N 530).

Если же организация не выставляла счета-фактуры, то это будет грубым нарушением правил учета доходов и расходов и объектов налогообложения (ст. 120 НК РФ).  Несмотря на выписанный штраф, также придется уплатить недоимку и пени (п. 5 ст. 108 НК РФ).

В данном случае организация обязана выставить счета-фактуры покупателям, т.к. это не право, а обязанность (п. 3 ст. 168, п. 3 ст. 169 НК РФ).

Обоснование  

ПРАВИТЕЛЬСТВО ВВЕЛО МОРАТОРИЙ НА ПРИМЕНЕНИЕ ШТРАФНЫХ САНКЦИЙ ПО НДС К ПРЕДПРИНИМАТЕЛЯМ НА УСН

 

Правительство приняло решение поддержать предпринимателей, применяющих упрощенную систему налогообложения и впервые ставших плательщиками налога на добавленную стоимость. К ним не будут применяться штрафные санкции за непредставление в срок первой декларации по НДС, если такая впервые подается за любой из кварталов 2025 года. Принятое решение поможет бизнесу в спокойном режиме провести перенастройку бухгалтерских учетных программ, а также изучить Порядок заполнения данной декларации.

 

Последствия выставления счета-фактуры позже срока

Ответственность продавца за выставление счета-фактуры позже установленного срока не предусмотрена Налоговым кодексом РФ.

Однако если вы должны выставить счет-фактуру в текущем квартале, а сделаете это в следующем, то информация о нем не попадет в декларацию по НДС за текущий квартал. При проверке инспекция может сопоставить показатели ваших отчетов, выявить это несоответствие и затребовать пояснения. Так как плательщик не отразил свою совокупную обязанность на ЕНС до проведения проверки, ему нужно подать уточненную декларацию, доплатить ЕНП и пени по недоимке. При этом, если на момент представления уточненки положительное сальдо ЕНС превышает сумму соответствующей недоимки и пени, штрафов не будет (п. 3 ст. 11.3, ст. 75, пп. 1 п. 4 ст. 81 НК РФ).

В случае несоблюдения указанных выше условий при представлении уточненной налоговой декларации, увеличивающей ваши налоговые обязательства, основания для освобождения от ответственности, предусмотренной ст. 122 НК РФ, отсутствуют. При этом штрафа в размере 20 процентов от неуплаченной суммы НДС не будет, если со дня, когда наступил срок уплаты налога, до дня представления уточненной декларации на вашем ЕНС непрерывно было положительное сальдо и (или) имелись денежные средства, зачтенные в счет уплаты налога, в размере, достаточном для уплаты недоимки (п. 4 ст. 122 НК РФ).

Если же вы не выставили счет-фактуру, то это будет грубым нарушением правил учета доходов и расходов и объектов налогообложения. Штраф составит (ст. 120 НК РФ):

• 10 000 руб., если вы не выставляли счета-фактуры в течение одного квартала;
• 30 000 руб., если вы не выставляли счета-фактуры в течение нескольких кварталов;
• 20% от суммы задолженности по налогу (но не меньше 40 000 руб.), если из-за невыставления счета-фактуры вы занизили налоговую базу по НДС.

 

Клиентский опыт

В дополнение к основному ответу мы хотели бы поделиться с Вами Клиентским опытом решения похожих задач. Вы можете ознакомиться с эффективной последовательностью действий в КонсультантПлюс по теме Вашего запроса в документе: «УСН: уплата НДС и другие изменения в 2025 году».

 

Готовое решение: Какие налоговые последствия предусмотрены за нарушение срока выставления счета-фактуры (КонсультантПлюс, 2025) {КонсультантПлюс}

Готовое решение: Какие штрафы и в каком размере предусмотрены за неуплату, неполную или несвоевременную уплату налогов (КонсультантПлюс, 2025) {КонсультантПлюс}

Информация: Правительство ввело мораторий на применение штрафных санкций по НДС к предпринимателям на УСН ("Официальный сайт ФНС России", 2025) {КонсультантПлюс}